Ο νέος Πρύτανης θα αναλάβει τα καθήκοντά του την 1η Σεπτεμβρίου με τετραετή θητεία. Ο Στυλιανός Ξανθόπουλος νυν Αντιπρύτανης Διοικητικών και Ακαδημαϊκών Υποθέσεων του Πανεπιστημίου Αιγαίου και Καθηγητής από το τμήμα της στατιστικής και αναλογιστικών χρηματοοικονομικών μαθηματικών της Σάμου ήταν ο μοναδικός υποψήφιος για το ανώτατο ακαδημαϊκό αξίωμα του ιδρύματος.
Στο νέο πρυτανικό σχήμα συμμετέχουν τέσσερις Αντιπρυτάνεις, με διακριτά χαρτοφυλάκια.
Ο καθηγητής Ευστράτιος Γεωργούλας αναλαμβάνει Αντιπρύτανης Διεθνοποίησης και Φοιτητικής Μέριμνας.
Η καθηγήτρια Νίκη Γλαβέλη αναλαμβάνει Αντιπρύτανις Διοικητικών Υποθέσεων, Στρατηγικής Επικοινωνίας και Βιωσιμότητας.
Ο καθηγητής Πολύκαρπος Καραμούζης αναλαμβάνει Αντιπρύτανης Ακαδημαϊκών Υποθέσεων, Διά Βίου Μάθησης και Εκπαιδευτικής Καινοτομίας.
Η καθηγήτρια Μαρία Καρύδα αναλαμβάνει Αντιπρύτανις Οικονομικών, Ψηφιακού Μετασχηματισμού και Υποδομών.
Η θητεία των νέων Πρυτανικών Αρχών του Πανεπιστημίου Αιγαίου θα ξεκινήσει την 1η Σεπτεμβρίου 2026.

