Σύμφωνα με τα επίσημα στοιχεία της Ομοσπονδιακής Υπηρεσίας Πολιτικής Αεροπορίας (FAA) και τα δεδομένα του Flightradar24, το περιστατικό σημειώθηκε στις 14:30, όταν η πτήση 4464 της Republic Airways (για λογαριασμό της American Airlines) παρεξέκλινε από την προκαθορισμένη πορεία προσέγγισης. Το αεροσκάφος εισήλθε ξαφνικά στη διαδρομή της πτήσης 554 της Jazz Aviation (για λογαριασμό της Air Canada), η οποία ετοιμαζόταν επίσης για προσγείωση, σύμφωνα με την New York Post.

Η απόσταση που χώριζε τα δύο αεροσκάφη ήταν μικρότερη από το μήκος ενός γηπέδου ποδοσφαίρου. Τα συστήματα ιχνηλάτησης κατέγραψαν το αεροσκάφος της Republic να χάνει 600 πόδια ύψος μέσα σε ελάχιστα δευτερόλεπτα πάνω από το ΛΟνγκ Μπιτς, ενώ ταυτόχρονα το αεροσκάφος της Jazz πραγματοποιούσε απότομη άνοδο 1.000 ποδών για να αποφύγει τη σύγκρουση.

Τα πληρώματα των δύο αεροσκαφών έλαβαν στα όργανά τους τη λεγόμενη «συμβουλή επίλυσης» (resolution advisory), την πιο σοβαρή προειδοποίηση που μπορεί να εκδώσει το αυτόματο σύστημα αποφυγής σύγκρουσης (TCAS). Το σήμα αυτό διατάζει τους πιλότους να αλλάξουν αμέσως ύψος, ανεξάρτητα από τις προηγούμενες οδηγίες, καθώς η απειλή θεωρείται άμεση. Η ψυχραιμία των πιλότων και η ταχύτατη ανταπόκριση στις εντολές του πύργου ελέγχου αποδείχθηκαν σωτήριες.

Το περιστατικό προκάλεσε έντονη ανησυχία στις αρχές και το επιβατικό κοινό, καθώς η Νέα Υόρκη παραμένει συγκλονισμένη από την αεροπορική τραγωδία που σημειώθηκε φέτος τον Μάρτιο, ότανστο αεροδρόμιο LaGuardia, ένα αεροσκάφος συγκρούστηκε με πυροσβεστικό όχημα μέσα στην πίστα, με αποτέλεσμα δύο πιλότοι να χάσουν τη ζωή τους.

Εκείνο το τρομακτικό δυστύχημα είχε ανοίξει έναν μεγάλο κύκλο συζητήσεων για τα πρωτόκολλα ασφαλείας στα αεροδρόμια της αμερικανικής μητρόπολης, και το νέο συμβάν στο JFK έρχεται να υπογραμμίσει τους κινδύνους που εγκυμονεί η πυκνή εναέρια κυκλοφορία πάνω από έναν από τους πιο πολυσύχναστους κόμβους του κόσμου. Η FAA έχει ήδη ξεκινήσει έρευνα για να διαπιστωθούν τα αίτια της επικίνδυνης παρέκκλισης της πτήσης της Republic Airways.