Η επιλογή του συγκεκριμένου ονόματος μόνο τυχαία δεν ήταν. Η λέξη «Παναθηναϊκός» εξέφραζε έναν όμιλο που δεν άνηκε μόνο σε μια τάξη ή γειτονιά αλλά σε ολόκληρη την Αθήνα και μετά από λίγο καιρό σε όλη την Ελλάδα.

Ο Παναθηναϊκός ήθελε να γίνει κάτι παραπάνω από μια ομάδα. Ήθελε να εκπροσωπεί ένα ήθος και μια κουλτούρα. Με το νέο όνομα έγινε και η επίσημη έναρξη ενός οργανωμένου πολυαθλητικού συλλόγου. Ο Παναθηναϊκός επένδυσε στο μπάσκετ, αλλά και σε άλλα αθλήματα όπως τον στίβο και την κολύμβηση, δημιουργώντας έτσι έναν όμιλο που…γέννησε πρωταθλητές σε όλα τα σπορ.

Η ιδέα ενός αθλητή του στίβου αρχικά και μετέπειτα του ποδοσφαίρου, που καταγόταν από τα Διλινάτα της Κεφαλλονιάς, του Γιώργου Καλαφάτη, έμελλε να φέρει ως αποτέλεσμα την ίδρυση ενός εκ των κορυφαίων συλλόγων της Ελλάδας, με πάρα πολλές επιτυχίες εντός κι εκτός των συνόρων.

Στο πλευρό του Γιώργου Καλαφάτη ήταν ο αδελφός του, Αλέξανδρος, και ο Δημήτρης Δουκάκης. Ο 18χρονος τότε, Γιώργος (γεννήθηκε το 1890) κατάφερε να πείσει τους παρευρισκομένους ότι η Αθήνα χρειαζόταν τη δημιουργία ενός συλλόγου, που λίγο αργότερα λατρεύτηκε όχι μόνο από τους Αθηναίους, αλλά σιγά-σιγά απόκτησε φιλάθλους σε όλα τα μήκη και τα πλάτη της ελληνικής επικράτειας.

Αφού ακούστηκαν πολλές απόψεις γύρω από την ονομασία του νέου συλλόγου, κατέληξαν όλοι στο «Ποδοσφαιρικός Όμιλος Αθηνών».

Τα εγκαίνιά του έγιναν στις 11 Μαΐου 1908 και τη διοίκηση του συλλόγου στελέχωναν οι Μ. Μαρινάκης (πρόεδρος), Γ. Αντωνόπουλος (αντιπρόεδρος), Κ. Θων (ταμίας), Κ. Γουλιμής (γεν. γραμματέας), Δ. Παππάς (έφορος) και οι σύμβουλοι Κ. Σταυρόπουλος, Ν. Αγκωνάκης, Ε. Χρύσης, Κ. Μάτσας, Γ. Σκουζές, Ι. Θεοφιλάς, Ι. Μπούμπουλης, Γ. Γαλανός, Α. Δημητρακόπουλος και Π. Παρασκευόπουλος.

Στις 9/9/1908 ο ΠΟΑ, με τον Γιώργο Καλαφάτη να κάνει τη διαφορά, κατακτά τον πρώτο του τίτλο. Παρ’ όλα αυτά, στα τέλη του επόμενου έτους (1909) παρατηρήθηκε έντονη διοικητική αστάθεια, προερχόμενη από την κόντρα του βασικού χρηματοδότη του ΠΟΑ, Μαρίνου Μαρινάκη, και του ιδρυτή του συλλόγου, Γιώργου Καλαφάτη.

Η ομάδα δεν πήρε μέρος στο ετήσιο πρωτάθλημα, ενώ τα περισσότερα μέλη του συλλόγου δε συμφωνούσαν με τις κινήσεις του Μ. Μαρινάκη. Αποτέλεσμα αυτής της εσωτερικής διαμάχης ήταν η διάσπαση του ΠΟΑ.

Στα χρόνια που ακολούθησαν, πέραν της καθιέρωσης της πράσινης-λευκής ενδυμασίας, ο Ποδοσφαιρικός Όμιλος Αθηνών μετονομάστηκε σε Πανελλήνιο Ποδοσφαιρικό Όμιλο (ΠΠΟ) και αργότερα σε Πανελλήνιο Ποδοσφαιρικό Αγωνιστικό Όμιλο (ΠΠΑΟ) μέχρι το 1924, οπότε πήρε την τελική ονομασία Παναθηναϊκός Αθλητικός Ομιλος (ΠΑΟ).